繁殖效率低
小龙虾的繁殖效率并不高。从孕期到虾苗长大，存活率很低。人工养殖情况下，养殖户缺乏经验，在预苗期内不知道如何处理，导致大量虾苗死亡。许多养殖户无法自产自销，只能持续购买虾苗，风险很大。
病害频繁
小龙虾是杂食性动物，不挑食，经常食用腐败食物。因此，小龙虾自身很容易受到病原体的侵袭。小龙虾生活的环境恶化速度快，有害物质积累较快。再加上小龙虾本身是一种容易吸引病原体的生物，因此病害风险一直是小龙虾养殖的较大考验。
竞争力大
目前全国各地都有小龙虾商品，巨大的市场机遇吸引了众多竞争者。养殖户面临的竞争压力逐年增加。一方面是老养殖户之间的竞争，另一方面是新入门者的加入。小龙虾市场的容量有限。随着产量的增加，越来越多的卖家开始注重细节，养殖户的投入也随之提高，市场竞争压力与日俱增。
伪劣虾种猖狂
虾苗问题也是目前日益突出的问题。许多养殖户在购买虾苗时提心吊胆，稍有不慎就可能出问题，风险极高。由于养殖户基本无法自行繁殖虾苗，只能选择购买，但是优质虾苗产量少，低劣虾种较多。许多人因此购买低劣虾种，随后以劣充优，扰乱市场。等到养殖户发现时为时已晚，只能蒙受损失。
区分标志
市面上常见的被称为蓝魔虾的种类有两种：Cheraxtenuimanus（marron）和Cheraxquadricarinatus（redclaw）。蓝魔虾这个名称最初源于美国佛罗里达的蓝色型美国螯虾，但后来由于进口商的误解，蓝色型marron也被冠以这个名称。实际上，将所有蓝色型淡水小龙虾统称为蓝魔虾是不准确的，因为并非所有蓝色虾都属于蓝魔虾的范畴。
其中，有一种国产的染色小蓝魔，母体是学名克原氏螯虾，也就是麻辣小龙虾的常见种类。这些虾通过食用含有色素的饲料，在蓝色培养液中饲养，导致原虾红素变化，呈现出蓝色。这种现象类似于玻璃虾因长期食用水草而变绿。
真正的澳洲蓝魔虾，又称为BlueMarron，原产于澳大利亚西南部，是世界上第二大体型的淡水虾，与染色的品种有着明显的区别。在购买时，一个重要的区分标志是观察甲壳表面的粗糙程度。真正的蓝魔虾甲壳粗糙，而假冒的品种表面则相对平滑。因此，识别这种差异是辨别真伪的关键。
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